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VENN图

描述说明:Venn图用于展示组间共有及组内独有的信息。分组建议:2-5组。
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    Venn图,也叫文氏图、韦恩图,用于显示元素集合重叠区域的图示[1-2]。John Venn 是十九世纪英国的哲学家和数学家,他在1881年发明了采用固定位置的交叉环形式,用封闭曲线表示集合及其关系的图形,因此被命名为韦恩图。


    应用Venn图,能够统计多个样本或多组样本中共有或独有的元素(如:基因、物种、功能、OTU等)的数目,直观的反应多个样本或多组样本的元素组成方面的异同。


    1、以微生物多样性分析为例,输入的二维数据表为otu_table,如图1。数据表的制作方法参照参数设置页面说明。

    图 1


    2、输入分组文件,分组文件应为txt格式,如图2。数据表的制作方法参照参数设置页面说明。

    图 2


    3、点击保存并运行即可。

    4、Venn图图表工具可用于调整分组的颜色方案,可选择是否显示柱形图或条形图。




    不同的颜色的圈代表不同环境或条件下的样本或样本组。如果两个不同颜色的圈中重叠区域标注数字14,表明两个样本中包含有相同的元素,且这样的元素有14个。Venn图一般可用于2-5个样本或2-5组样本的相似性及重叠情况的分析。


    [1] Fouts D E, Szpakowski S, Purushe J,et al. Next generation sequencing to define prokaryotic and fungal diversity in the bovine rumen.[J]. Plos One, 2012, 7(11):e48289.

    [2] Ruvindy R, Iii R A W, Neilan B A,et al. Unravelling core microbial metabolisms in the hypersaline microbial mats of Shark Bay using high-throughput metagenomics[J]. Isme Journal, 2015, 10(1):183.


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