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差异分析——两组比较

描述说明:两组比较是根据得到的两组样本的属性丰度数据,运行严格的统计学法,对其每个属性进行假设检验,评估属性丰度差异的显著性水平,获得两组间显著性差异属性。
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    两组比较是根据得到的两组样本的属性丰度数据,运行严格的统计学法,对其每个属性进行假设检验,评估属性丰度差异的显著性水平,获得两组间显著性差异属性。

    1、输入进行两组比较分析的属性丰度数据表,文件应为txt格式,行名为属性名,列名为样本名,如图1。数据表的制作方法参照参数设置页面说明。                     

    图1


    2、输入分组文件,分组文件应为txt格式,组别数等于2,且分组方案中的样本应与丰度数据表中的样本保持一致,表头#sample不可更改,如图2。分组方案可参照设置页面说明。

    样本数量要求:检验方式选择welch和student时,每组样品数≥3;检验方式选择mann时,每组样品数≥4;检验方式选择signal时,每组样品数≥6,且每组样本数相等。


    图2


    3、选择检验方法:提供了4种检验方法,studentStudent's T检验,welchWelch T检验,mannWilcoxon为秩和检验,signalWilcoxon符号秩和检验。

    4、选择CI计算方法,并填写置信度和显著性水平阈值。

    5、选择多重检验校正方法:默认为fdr

    6、选项单双尾检验:用于指定所求置信区间的类型,two.side双尾检验,less为右尾检验,greater为左尾检验。

    7、点击保存并运行,即可生成分析结果图,如图3

    8、图表工具可用于调整分组颜色,是否显示P值、显示丰度前多少的属性等对呈图进行优化。

    9、点击列表展示,可查看差异检验结果表及每个属性对应的单属性差异检验比较柱形图和箱式图。


    图3


    注:纵坐标表示属性名,横坐标表示该组样本的某一属性丰度的百分数数值,不同颜色表示不同分组。0.01<p<=0.05 * 0.001< p <=0.01 ** p<=0.001 ***



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