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差异分析——两样本比较

描述说明:两样本比较是根据得到的两样本的属性丰度数据,运行严格的统计学法,对其每个属性进行假设检验,评估属性丰度差异的显著性水平,获得两样本间显著性差异属性。
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    两样本比较是根据得到的两样本的属性丰度数据,运行严格的统计学法,对其每个属性进行假设检验,评估属性丰度差异的显著性水平,获得两样本间显著性差异属性。


    1、输入进行两样本比较分析的属性丰度数据表,文件应为txt格式,行名为属性名,列名为样本名,如图1。数据表的制作方法参照参数设置页面说明。



    图1


    2、输入进行比较的两个样本名称。名称应与丰度数据表中的样本名称保持一致。

    3、选择检验方法:提供了2种检验方法,chi对应的是卡方检验,fisher对应的是Fisher's 精确检验

    4、选项单双尾检验:用于指定所求置信区间的类型,two.side双尾检验,less为右尾检验,greater为左尾检验。

    5、选择CI计算方法,并填写置信度和显著性水平阈值。

    6、选择多重检验校正方法:默认为fdr

    7、点击保存并运行,即可生成分析结果图,如图2。

    8、图表工具可用于调整分组颜色,是否显示P值、显示丰度前多少的属性等对呈图进行优化。

    9、点击列表展示,可查看差异检验结果表。




    图2

    注:纵坐标表示属性名,横坐标表示该样本的某一属性丰度的百分数数值,不同颜色表示不同样本。0.01<p<=0.05 * 0.001< p <=0.01 ** p<=0.001 ***

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