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多样性流程介绍

微生物多样性分析主要关注微生物群落结构组成、微生物群落结构在样本间的变化差异、环境因子对群落结构的影响等方面。I-sanger的多样性分析流程集成业内普遍认可的QIIME、mothur对测序数据进行分析,生成的图表符合专业期刊的要求。在工作流程界面,按照步骤一到步骤五的顺序,选择感兴趣的拼接后的Fastq格式的文件,上传分组信息表以及环境因子表,选择比对数据库,设定分析参数,点击保存并运行,即可实现微生物多样性项目的交互分析。在交互分析页面中,用户可以自由执行挑选样本、更改分组、配色等操作,不必反复沟通等待,大大缩短了项目周期。 

目前,多样性分析流程的交互分析页面主要包括八个分析模块:数据质控,物种注释与评估,物种组成分析,样本比较分析,物种差异分析,关联与模型预测分析,进化分析,16S功能预测。全面覆盖了微生物多样性生信分析内容,也会根据用户的需求对分析内容进行更新扩展。每个分析模块的首页对各项生信分析进行了详细的知识背景介绍,帮助用户快速了解各项分析内容的应用和生物学意义。 

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