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如何进行基因/转录本的表达量筛选、排序?

第一步:

点击【表达量分析】模块下的【表达量统计】,选择【表达量矩阵】下的【表达量分析结果表】中点击【筛选表格】,出现如图1所示界面。

通过【切换数据】,可实现对基因还是转录本进行筛选;

通过【样本】,可实现样本以分组的形式展现;

通过【表达量】,筛选出表达量“大于”、“小于”、“等于”、“大于等于”、“下于等于”某个值的基因;

通过【显示基因集】,选择已创建基因集,则可呈现该基因集中的基因/转录本在样本中的表达情况;

通过【gene_id】,可筛选出某个一个基因在样本中的表达情况。

最后,点击【确认】,则实现对表达量分析结果表的筛选。

 

 

图1

 

第二步:

点击【确认】后,会生成符合筛选条件的表达量分析结果表,如图2。

可点击【样本】旁边的正反“Δ”实现该组表达量按照升序或降序进行排列功能。

点击【创建基因集】,可将符合筛选条件的基因/转录本创建一个基因的集合,对其进一步的研究,如查看其差异表达情况、基因注释和富集以及聚类分析等。

点击“gene id”左侧列,可呈现出该基因在各个样本表达的趋势图,如图3

 

 

图2

 

 

3

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