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多个样品的转录组,如何确定是将所有样品一起拼接还是每个样品分开拼接?

样品分开拼接的情况,一般适用于不同的物种,同一属不同的种或者同一物种不同的品系。通过分析同源基因受选择压力情况从而鉴定亲缘关系。 
同一物种不同个体的混样,或者同一个体不同组织部位,发育阶段样品建议一起拼接能够得到该物种更全的转录组数据。 

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